آزمایشهای هورمونی در این بخش به دو روش: ECLIA) Electro Chemi Luminescence) Elisa) Enzyme- Linked Immunoab Sorbent Assay) به شکل روزانه و هفتگی انجام می‌شوند. بهره گیری از سه دستگاه برتر دنیا جهت اندازه‌گیری هورمونها شرکت مداوم در برنامه کنترل کیفی استفاده از دستگاههای تمام اتوماتیک انجام آزمایشهای غربالگری مادران باردار با نرم‌افزار مورد تایید مرجع سلامت انجام کلیه آزمایشهای تخصصی هورمون شناسی بدون نیاز به ارسال EC) Chemi Luminescence) در آزمایشگاه کوثر، از دستگاه تمام اتوماتیک Maglui 800 ساخت شرکت Snibe استفاده می شود. تمام کیتها وارداتی بوده و مشابه ایرانی آن وجود ندارد. حساسیت، تکرارپذیری، دقت و صحت این روش قابل مقایسه با سایر روش‌های آزمایشگاهی نیست به همین علت مورد اطمینان و تایید اکثر متخصصین مجرب و به نام کشورمان می‌باشد. کیتها و دستگاه VIDAS (روش ELFA) بصورت انحصاری توسط شرکت Biomerieux فرانسه تولید شده و توسط شرکت ایرانی فردآور عرضه و پشتیبانی می‌گردد. کیتها و دستگاه i-Chroma (روش ELFA) نیز بصورت انحصاری در کره جنوبی تولید شده و توسط شرکت ایرانی پنتا در کشور عرضه و پشتیبانی می‌گردد. کنترل کیفی مانند سایر بخش‌ها، در این بخش نیز برنامه‌های کنترل کیفی در نظر گرفته شده است که توسط مسئول مربوطه در بخش و مسئول فنی کنترل می‌گردد.
